* Handgeschakelde vijfversnellingsbak: Dit was een standaardoptie voor verschillende modellen.
* Automaat met 4 versnellingen: Ook verkrijgbaar in een reeks modellen.
* Automaat met 5 versnellingen: Dit was beschikbaar op sommige V6-modellen.
Daarom is er geen eenduidig antwoord. Je moet het specifieke uitrustingsniveau en de specifieke motor van de Mustang uit 2006 kennen om zeker te weten welke transmissie hij heeft.