CNG-auto's hebben een apart brandstofsysteem dat bestaat uit een CNG-tank, een drukregelaar en een brandstofinjector. De CNG-tank slaat het gecomprimeerde aardgas onder hoge druk op. Wanneer de motor brandstof nodig heeft, verlaagt de drukregelaar de druk van het CNG en de brandstofinjector spuit het in de cilinders van de motor, waar het wordt gemengd met lucht en wordt ontstoken om verbranding te produceren en het voertuig van stroom te voorzien.
Benzineauto's daarentegen hebben een brandstofsysteem dat is ontworpen voor benzine. Benzine wordt opgeslagen in een brandstoftank en via een brandstofleiding naar de brandstofinjector van de motor gepompt. De brandstofinjector spuit benzine in de cilinders van de motor, waar het wordt gemengd met lucht en wordt ontstoken om verbranding te produceren en het voertuig van stroom te voorzien.
Hoewel het voor CNG-auto's zonder ingrijpende aanpassingen niet mogelijk is om op benzine te rijden, zijn er wel enkele bifuelvoertuigen beschikbaar die zowel op CNG als op benzine kunnen rijden. Deze voertuigen hebben twee afzonderlijke brandstofsystemen en kunnen afhankelijk van beschikbaarheid of voorkeur wisselen tussen brandstoffen.
