* Infrastructuur: Er moet een enorm netwerk van waterstoftankstations worden gebouwd. Dit is een enorm dure onderneming, die veel verder gaat dan de huidige investering. Het duurde tientallen jaren om de bestaande tankstationinfrastructuur te ontwikkelen.
* Productiekosten: Het produceren van groene waterstof (waterstof gemaakt uit hernieuwbare energiebronnen) is momenteel duur. Hoewel de kosten dalen, moeten ze aanzienlijk dalen om waterstofauto’s concurrerend te maken met elektrische auto’s.
* Voertuigkosten: Voertuigen met waterstofbrandstofcellen zijn complex en duur in de productie. De kosten van de brandstofcellen zelf zijn een belangrijke factor.
* Energie-efficiëntie: Het proces van het produceren, transporteren en gebruiken van waterstof is minder energie-efficiënt dan het direct gebruiken van elektriciteit in batterij-elektrische voertuigen (BEV’s).
Hoewel sommige waterstofautomodellen al beschikbaar zijn (hoewel zeer beperkt en duur), zullen de noodzakelijke infrastructuur en kostenbesparingen voor brede adoptie nog vele jaren op zich laten wachten. Batterij-elektrische voertuigen maken momenteel veel snellere vooruitgang dankzij de reeds bestaande elektriciteitsinfrastructuur en de snel dalende batterijkosten. Het is waarschijnlijker dat BEV's in de nabije toekomst de markt zullen domineren, waardoor er mogelijk een nicherol overblijft voor waterstofvoertuigen in specifieke toepassingen zoals zwaar vrachtvervoer, waar de batterijtechnologie voor grotere uitdagingen staat.
