Voor zowel de 3,4 liter V6 als de 2,7 liter viercilinder:
* Kleppendekselpakkingen: Lekken zijn een veel voorkomend probleem, dat kan leiden tot olielekkage en mogelijke motorschade als het onbeheerd wordt achtergelaten. Dit is vaak merkbaar als olievlekken op de motor.
* Olielekken: Naast de pakkingen van het kleppendeksel kunnen ook andere bronnen, zoals krukasafdichtingen en achterste hoofdafdichtingen, lekken, waardoor reparatie opnieuw nodig is.
* Distributieriem/ketting (afhankelijk van de motor): De 3,4 liter V6 heeft een distributieriem, die vervangen moet worden op de aanbevolen intervallen (meestal rond de 150.000 tot 170.000 kilometer). Een defect kan tot catastrofale motorschade leiden. De 2,7 liter viercilinder heeft een distributieketting, die over het algemeen duurzamer is, maar na verloop van tijd nog steeds kan uitrekken of defect kan raken.
* Waterpomp: Een defecte waterpomp kan oververhitting veroorzaken, wat tot ernstige motorproblemen kan leiden. Vaak gekoppeld aan het vervangen van de distributieriem op de V6.
Meer specifiek voor de 3,4 liter V6:
* Inlaatspruitstukpakkingen: Deze kunnen lekken, waardoor een slechte werking, vacuümlekken en mogelijke brandfouten ontstaan.
* Uitlaatspruitstuk lekt: Scheuren of lekkages in het uitlaatspruitstuk kunnen leiden tot verminderde prestaties en uitlaatgassen in de motorruimte.
* Gaskleppositiesensor (TPS): Een defecte TPS kan de motorprestaties beïnvloeden, waardoor slecht stationair draaien, aarzeling of afslaan ontstaat.
Meer specifiek voor de 2,7 liter viercilinder:
* Problemen met de koppakking: Hoewel het minder vaak voorkomt dan bij andere motoren, kunnen defecten aan de koppakking nog steeds optreden, vooral bij oververhitting.
Belangrijke opmerking: De leeftijd van het voertuig is een belangrijke factor. Veel van deze problemen treden vaker op naarmate de 4Runner ouder wordt en meer kilometers aflegt. Regelmatig onderhoud, inclusief het verversen van de olie, inspecties en het volgen van het door Toyota aanbevolen onderhoudsschema, is van cruciaal belang om veel van deze motorproblemen te voorkomen. Het negeren van kleine lekkages of ongebruikelijke geluiden kan later tot veel duurdere reparaties leiden.
