Het meest opvallende verschil is de verplaatsing. De 3,3 liter motor heeft een cilinderinhoud van 201 kubieke inch, terwijl de 3,5 liter motor een cilinderinhoud heeft van 215 kubieke inch. Dit verschil in cilinderinhoud betekent dat de twee motoren verschillende boring- en slagafmetingen hebben. De 3.3L-motor heeft een boring van 3,65 inch en een slag van 3,35 inch, terwijl de 3.5L-motor een boring van 3,80 inch en een slag van 3,20 inch heeft.
Het verschil in boring- en slagafmetingen betekent ook dat de twee motoren verschillende cilinderkoppen hebben. De 3.3L-motor heeft een cilinderkop die is ontworpen voor een kleinere boring, terwijl de 3.5L-motor een cilinderkop heeft die is ontworpen voor een grotere boring. Dit verschil in cilinderkopontwerp zou het moeilijk maken om de twee motoren te verwisselen zonder ook de cilinderkoppen te verwisselen.
Er zijn ook verschillen in de inlaat- en uitlaatspruitstukken, het brandstofinjectiesysteem en het motormanagementsysteem tussen de twee motoren. Dit zou het moeilijk maken om de 3.3L-motor in de Intrepid uit 1998 correct te installeren en te bedienen.
Concluderend kan worden gesteld dat de 3,3 liter-motor van een Intrepid uit 1995 geen directe vervanging is voor de 3,5 liter-motor in een Intrepid uit 1998. De verschillen tussen de twee motoren zijn zo groot dat de uitwisseling moeilijk, zo niet onmogelijk zou zijn.