* 5-versnellingsbak automatisch: Dit was de standaard transmissie.
* handgeschakelde 6-versnellingsbak: Dit was alleen beschikbaar op het SR5 -uitrustingsniveau.
Het is belangrijk op te merken dat de transmissie van de 4Runner is gekoppeld aan een 4.0L V6 of een 4.7L V8 -motor, afhankelijk van het specifieke uitrustingsniveau en de configuratie.